Если и та и другая одной марки и толщины, то разницы нет. Как правило полированная используется для наружных сегментов утепленных труб. Но кто-то делает неутепленные сегменты полированными. Уточните марки нержавеющих сталей заинтересовавших вас дымоходов и сравните их.